Transmission cluster of COVID-19 cases from Uruguay: emergence and spreading of a novel SARS-CoV-2 ORF6 deletion

BACKGROUND Evolutionary changes in severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) include indels in non-structural, structural, and accessory open reading frames (ORFs) or genes. OBJECTIVES We track indels in accessory ORFs to infer evolutionary gene patterns and epidemiological links between outbreaks. METHODS Genomes from Coronavirus disease 2019 (COVID-19) case-patients were Illumina sequenced using ARTIC_V3. The assembled genomes were analysed to detect substitutions and indels. FINDINGS We reported the emergence and spread of a unique 4-nucleotide deletion in the accessory ORF6, an interesting gene with immune modulation activity. The deletion in ORF6 removes one repeat unit of a two 4-nucleotide repeat, which shows that directly repeated sequences in the SARS-CoV-2 genome are associated with indels, even outside the context of extended repeat regions. The 4-nucleotide deletion produces a frameshifting change that results in a protein with two inserted amino acids, increasing the coding information of this accessory ORF. Epidemiological and genomic data indicate that the deletion variant has a single common ancestor and was initially detected in a health care outbreak and later in other COVID-19 cases, establishing a transmission cluster in the Uruguayan population. MAIN CONCLUSIONS Our findings provide evidence for the origin and spread of deletion variants and emphasise indels' importance in epidemiological studies, including differentiating consecutive outbreaks occurring in the same health facility.

Desenlaces maternos y neonatales relacionados con edad materna avanzada / Maternal and neonatal outcomes in advanced maternal age

Resumen OBJETIVO: Describir los desenlaces maternos y perinatales en embarazadas de edad avanzada. MATERIALES Y MÉTODOS: Estudio de dos cohortes, prospectivo y retrospectivo efectuado con base en la información de expedientes clínicos de pacientes atendidas en el Complexo Hospitalario Universitario de Ourense entre 2017 y 2018. Se establecieron dos cohortes: la cohorte A con edad mayor o igual a 40 años y la cohorte B con edad menor de 40 años. Se realizaron pruebas paramétricas y no paramétricas para determinar la asociación potencial entre las variables de estudio (χ2, t de Student, U de Mann-Whitney). RESULTADOS: Las pacientes de la cohorte A (n = 207) tuvieron significación estadística: índice de masa corporal mayor al inicio del embarazo (p = 0.028), mayor cantidad de embarazos previos (p = 0.001), a expensas de mayor cantidad de abortos (p < 0.001), estados hipertensivos del embarazo (p = 0.03), prematurez (p = 0.009), retraso en el crecimiento intrauterino (p = 0.006), macrosomía fetal (p = 0.04), inducciones (p < 0.001), cesáreas programadas o intraparto y hemorragia posparto (p = 0.001). No se encontraron diferencias en la paridad, amenorrea al parto, diabetes pregestacional-gestacional, peso fetal medio, Apgar, pH de la arteria umbilical y cantidad de recién nacidos con requerimiento de ingreso a la unidad de Neonatología. CONCLUSIONES: La edad materna avanzada es un factor de riesgo importante de morbilidad materna y perinatal. La mayor tasa de complicaciones descritas refleja la importancia del control exhaustivo del embarazo y vigilancia periparto minuciosa.

Abstract OBJECTIVE: To describe the maternal and perinatal results in pregnant women with advanced age. MATERIALS AND METHODS: A cohort study was conducted with prospective follow-up and retrospective data collection of the Clinical History of the University Hospital Complex of Ourense between 2017 and 2018. Two cohorts were established, cohort A with age greater than and equal to 40 years and the cohort B with age under 40 years. Parametric and non-parametric tests were performed to determine the potential association between the study variables (Chi-Square, Student's T, Mann-Whitney U). RESULTS: The cohort A patients (n = 207) presented with statistical significance: body mass index higher at the beginning of pregnancy (p = 0.028), higher number of previous pregnancies (p = 0.001), but at the expense of a higher number of abortions (p <0.001), hypertensive states of pregnancy (p = 0.03), prematurity (p = 0.009), intrauterine growth retardation (p = 0.006), fetal macrosomia (p = 0.04), inductions (p < 0.001), of both scheduled and intrapartum caesarean sections and postpartum hemorrhage (p = 0.001). No differences were found in parity, amenorrhea at delivery, pregestational / gestational diabetes, mean fetal weight, Apgar score, umbilical artery pH and number of newborns who required admission to the Neonatal Unit. CONCLUSIONS: Advanced maternal age is an important risk factor for maternal and perinatal morbidity. The higher rate of complications described reflects the importance of thorough pregnancy control and careful peripartum surveillance.

Morbilidad y mortalidad a largo plazo en mujeres con antecedente de desprendimiento prematuro de placenta normoinserta / Long-term morbidity and mortality in women with a history of premature placental abruption normoinserta

Resumen OBJETIVOS: Analizar las consecuencias a largo plazo del desprendimiento prematuro de placenta normoinserta, principalmente la incidencia de enfermedad cardiovascular y secundariamente otras causas de morbilidad y mortalidad (diabetes, neoplasias o trastornos psiquiátricos). MATERIALES Y MÉTODOS: Estudio de casos y controles, con recolección retrospectiva de datos de pacientes embarazadas que acudieron al Complexo Hospitalario Universitario de Ourense entre 1996 y 2008. El criterio de inclusión en el grupo casos fue el antecedente de desprendimiento prematuro de placenta normoinserta. El grupo control lo integraron pacientes con parto anterior y posterior al grupo de casos y que no habían sufrido desprendimiento de placenta. Las historias clínicas se analizaron mediante la recolección de datos de la "gestación índice" y se realizó el seguimiento a largo plazo para establecer el diagnóstico de hipertensión arterial, diabetes mellitus, enfermedad cardiovascular, neoplasias o alteraciones psiquiátricas. Para el análisis estadístico se requirió el programa SPSS15.0. Se consideró estadísticamente significativo el valor de p < 0.05. RESULTADOS: Se estudiaron 198 mujeres: 66 en el grupo de casos y 132 en el grupo control. Durante el seguimiento (15.8 ± 3.58 años), la incidencia de diabetes mellitus y dislipidemia fue mayor en el grupo de casos, pero sin significación estadística. No se encontraron diferencias en la incidencia de hipertensión arterial, síndrome metabólico, enfermedad cardiovascular ni trastorno ansioso-depresivo. En el grupo de casos se encontró una alta tasa de enfermedad neoplásica. CONCLUSIONES: No existe relación entre desprendimiento prematuro de placenta y enfermedad cardiovascular. Se carece de una explicación que justifique la alta tasa de patología tumoral en este grupo de pacientes.

Abstract OBJECTIVE: To analyze if women with a history of premature placental abruption have a long-term increase in morbidity and mortality. MATERIALS AND METHODS: Case-control study with retrospective data collection of pregnant women from the Hospital University Complex of Ourense between 1996 and 2008. The criteria for inclusion in the case group were the history of placental abruption. The control group was constituted by the women with previous and subsequent delivery to the case group and who had not presented placental abruption. The clinical histories were analyzed with data collection of the index pregnancy and a long-term follow-up was carried out to detect the subsequent diagnosis of arterial hypertension, diabetes mellitus, cardiovascular disease, as well as neoplastic and psychiatric pathology. The statistical study was carried out using the SPSS15.0 computer program. Values of p < 0,05 were considered significant results. RESULTS: A total of 198 women were studied, of which 66 belong to the case group and 132 to the control group. In the follow-up period (15,8±3,58 years) the incidence of diabetes mellitus and dyslipidemia was higher in the case group, but without statistical significance. No differences were found in the incidence of hypertension, metabolic syndrome, cardiovascular disease or anxiety-depressive illness. In the case group, a high rate of oncological pathology was found. CONCLUSIONS: We found no relationship between the history of placental abruption and cardiovascular disease. We lack an explanation that justifies the high rate of tumor pathology in this group of women.

Influence of propofol dose and blood components on duration of electrical seizures in electroconvulsive therapy / Influência da dose de propofol e dos componentes sanguíneos na duração das convulsões elétricas em eletroconvulsoterapia

Abstract Background and objectives: Propofol is commonly employed as a hypnotic agent to perform electroconvulsive therapy, but it exhibits also anticonvulsant properties. The main objective was to study the effect of the weight-adjusted dose of propofol on duration of the electrical seizure. Secondary objectives were to study the effect of absolute dose of propofol on duration of electrical seizure, the effect of both absolute and weight-adjusted doses on values of bispectral index, and the influence of blood chemistry on anticonvulsant effect. Methods: After approval of the Institutional Review Board, a retrospective chart review was performed of all patients who underwent at least one electroconvulsive therapy session. Multiple lineal regression analysis adjusted for potential confounders was employed to explore the effect of propofol dosage on values of bispectral index and on duration of seizure; bivariate correlation analyses were previously performed to identify variables fulfilling confounding criteria, specifically values of Spearman's rho >0.10. Results of regression analysis were expressed as B coefficient with its 95% confident interval. Results: 76 patients received 631 acute phase sessions. Propofol showed a statistically significant negative effect on duration of seizure (specifically a reduction of 4.081 s for every mg.kg−1 of propofol; CI95%: −7906 to −0.255, p = 0.037) but not on bispectral index values. Slight anemia and hypoalbuminemia were very infrequent conditions, and the anticonvulsant effect was not influenced by these parameters. Conclusions: Propofol weight-adjusted dose is negatively related to duration of seizures. It should be carefully titrated when employed to perform electroconvulsive therapy.

Resumo Justificativa e objetivos: O propofol é comumente usado como agente hipnótico na terapia eletroconvulsiva, mas apresenta também propriedades anticonvulsivantes. O objetivo principal foi avaliar o efeito da dose de propofol ajustada ao peso na duração da convulsão elétrica. Os objetivos secundários foram avaliar o efeito da dose total de propofol na duração da convulsão elétrica, o efeito da dose tanto total quanto ajustada ao peso nos valores do índice bispectral e a influência da bioquímica do sangue no efeito anticonvulsivante. Métodos: Após aprovação do Comitê de Ética em Pesquisa, foi feita uma revisão retrospectiva dos prontuários de todos os pacientes que fizeram pelo menos uma sessão de eletroconvulsoterapia. Análise de regressão linear múltipla ajustada para potenciais confundidores foi feita para explorar o efeito da dosagem de propofol sobre os valores do índice bispectral e a duração da convulsão; análises de correlação bivariada foram previamente feitas para identificar as variáveis que atendem aos critérios de confusão, especificamente valores de r de Spearman > 0,10. Os resultados da análise de regressão foram expressos como coeficiente B com intervalo de confiança de 95%. Resultados: Setenta e seis pacientes receberam 631 sessões de fase aguda. Propofol mostrou um efeito negativo estatisticamente significativo sobre a duração da convulsão (especificamente uma redução de 4,081 segundos para cada mg.kg−1 de propofol; IC de 95%: -7906 para -0,255, p = 0,037), mas não para os valores do índice bispectral. Anemia leve e hipoalbuminemia foram condições muito raras e o efeito anticonvulsivante não foi influenciado por esses parâmetros. Conclusões: A dose de propofol ajustada ao peso está negativamente relacionada com a duração das crises convulsivas, deve ser cuidadosamente titulada quando usada na terapia eletroconvulsiva.

Caracterización clínica del dengue hemorrágico en niños / Clinical features of hemorrhagic dengue in children

Objetivos: Determinar los síntomas presentes al ingreso que predicen evolución a dengue hemorrágico. Material y métodos: Se realizó un estudio de casos y controles de 88 pacientes ingresados en el servicio de pediatría del Hospital "Dr. Enrique Baltodano" de Liberia en el año 2003. Los pacientes incluidos en el estudio tuvieron serología positiva IgM al egreso. Se realizó la fase descriptiva sexo, edad y posteriormente un análisis multivariado de las variables clínicas asociadas con evolución a dengue hemorrágico. Resultados: De los 88 pacientes, 22 evolucionaron a dengue hemorrágico y 66 a dengue clásico. 39.8 por ciento (n igual 35) masculinos, 60.2 por ciento (n igual 53) femeninos. La edad promedio en años 5.2 años los dengues hemorrágicos y 7.7 años los dengues clásicos. La estancia promedio en días: 4 para los diagnosticados por dengue hemorrágico y 2.7 los diagnosticados con dengue clásicos. Dolor abdominal y dolor retroocular son los predictores independientes de dengue hemorrágico en niños. Los hallazgos de ultrasonido fueron ascitis en 45 por ciento (n igual 10) y 55 por ciento (n igual 12) además de ascitis, derrame pleural y edema de vesícula. Conclusiones: Dolor abdominal y retroocular detectados al ingreso son los predictores independientes de dengue hemorrágico.

Efectividad y Continuidad de la anticoncepción en el Municpio Diez de Octubre / Effectiveness and continuity of contraception at the municipality of diez de octubre

Una de las formas de valorar el uso adecuado de la anticoncepción y la eficacia de la planificación familiar es conociendo la efectividad y continuidad de los métodos anticonceptivos. El objetivos de este trabajo es mostrar las tasas de efectividad, abandono y fallo de la anticoncepción en mujeres del municipio Diez de Octubre. La información proviene de un proyecto financiado por el Programa de Reproducción Humana de la Organización Mundial de la Salud 'Contracepción y Factores Asociados'. Se utilizó la historia de uso de anticonceptivos de 876 mujeres. Mediante la tabla de vida se obtuvieron todos los indicadores. Las tasas de fallo encontradas van desde 12,67 por cien episodios para los métodos tradicionales, a 5,26 para los DIU tuvo una tasa de fallo de 18,01 por cien episodios. Se encontró diferencia significativa al 0,0001 (con la prueba de Lee-Disu) para el comportamiento del fallo y del abandono en relación con los antecedentes de hijos y abortos previos al inicio del uso. Se concluye que las tasas de fallo del DIU es una de las más altas en comparación con países con información y que tanto el fallo como el abandono de los DIU es elevado. Se recomienda que en el municipio se revisen las orientaciones del uso del DIU para beneficio de la salud reproductiva de las mujeres y aumento de la efectividad de los métodos

Purificacion de la Proteina de 24 KD natural (P24) del virus de inmunodeficiencia humana tipo-1 (VIH-1) utilizando inmunoafinidad / Purification of HIV-1 24 KD natural protein (p24)by immunoaffinity

En el seguimiento de las personas afectadas con el VIH-1 resulta de gran utilidad el empleo de sistemas para detectar la presencia de proteina de 24 KD y los niveles de anticuerpos a esta; para el desarrollo de estos sistemas es necesario contar con esta proteina purificada. El presente trabajo describe la purificacion de p24 a partir de lisado rival semipurificado sobre gradiente de sacarosa, empleando cromatografia de inmunoafinidad con anticuerpos monoclonales acoplados a Sefarosa 4B activada con bromuro de cianogeno. Para la caracterizacion del producto purificado se utilizo electroforesis en gel de poliacrilamida con tincion de plata e inmunoelectrotransferencia. Como resultado de este trabajo se obtuvo p24 util para ser empleada en el desarrollo de medios diagnosticos y anticuerpos monoclonales

Displasia oculoauriculovertebral: síndrome de Goldenhar / Oculoauriculovertebral dysplasia: Goldenhar's syndrome

El Síndrome de Goldenhar o displasia oculoauriculovertebral, pertenece al grupo de los síndromes otocraneofaciales con afectación asimétrica de las estructuras del cráneo y de la cara. Se caracteriza por dermoides preauriculares, malformación de los pabellones auriculares y anomalías vertebrales y pueden asociarse a otras anomalías viscerales toracoabdominales y de extremidades. Estudiamos 5 pacientes oftalmológica, genética y clínicamente y destacamos las malformaciones oculares que caracterizan esta enfermedad

Control del estado nutricional de las mujeres en edad fértil como factor influyente en la disminución de la mortalidad infantil: provincia La Habana 1979-1983 / Control of nutritional status of fertile age women as influencing factor in the decrease of infantile mortality: Havana Province, 1979-1983

Se realiza una encuesta a 69 655 mujeres en edad fértil de 15 a 49 años, en municipios de la provincia La Habana. Se confecciona una tarjeta que recoge: edad, peso, talla y valoración nutricional de las mismas, además de los datos de identificación personal. Se realiza un análisis de la valoración nutricional de la mujer con los datos obtenidos en la encuesta y éste arroja que existe un total de 9 947 mujeres con bajo peso en la muestra provincial y que en el grupo de mujeres de 15 a 19 años recae el mayor número de bajo peso, así como que de las mujeres con sobrepeso y obesas, el mayor porcentaje se encuentra en los grupos de edades de 40 a 49 años. Se observa, en relación con la talla, que en las mujeres más jóvenes hay mejores índices que en las mujeres más viejas. Se describen acciones de salud sobre las mujeres malnutridas por defecto, en las que se produce el mayor riesgo de bajo peso al nacer

Vulvovaginitis neonatal por trichomonas vaginalis: presentación de un caso clínico / Neonatal trichomonas vaginalis vaginitis: report of a clinical case

Se presenta un caso de vulvovaginitis neonatal producida por Trichomonas vaginalis en una niña de 20 días de edad, quien se contaminó al pasar por el canal vaginal infectado de su madre. Se hace una revisión de la literatura disponible; y además un breve comentario sobre el agente etiológico, haciendo énfasis en la importancia de su diagnóstico

Peso al nacer y factores maternos en 5 municipios de las territoriales de la provincia La Habana en el año 1983 / Birth weight and maternal factors in 5 municipalities of territorialities of Havana Province 1983

Se abordó el estudio del peso al nacer con los factores maternos asociados. Se obtiene al final una muestra de 967 casos a los cuales se les aplicó la regresión paso a paso como técnica de análisis estadístico multivariado. Se indica que el coeficiente de determinación fue de 0,21 y los factores maternos que resultaron más importantes en la determinación del peso al nacer fueron en este orden: edad gestacional, peso inicial, incremento de peso durante la gestación, sexo, hábito de fumar, talla y orden de nacimiento

Importancia del control de mujeres en edad fértil en la disminución de la mortalidad infantil en la provincia de la Habana: años 1979-1983 / Importance of the control of women at fertile age in the decrease of infantile mortality in Havana province: 1979-1983

En la provincia de La Habana se realiza el control del grupo de mujeres de 15-49 años desde 1979 mediante un modelo que recoge datos personales y relacionados con la anticoncepción de cada una de ellas. Conjuntamente se realizan acciones de salud con el objetivo de planificar la familia mediante métodos anticonceptivos en las mujeres controladas que puedan ser causa de mayor riesgo de morbimortalidad materna e infantil. En el período estudiado se han controlado un 60 de mujeres de este grupo etáreo, de las cuales el 66,7 tenían algún método anticonceptivo transitorio. La esterilización quirúrgica constituyó el 16,7 de estas mujeres. En el grupo de riesgo controlado, sin embargo, la esterilización quirúrgica se llevó hasta el 27,7 de los casos. Se observó en los 5 años siguientes una tendencia descendente de la mortalidad infantil y tasas inferiores a 16,4 por 1000 nacidos vivos

Factores que influyen en la mortalidad infantil: provincia La Habana: año 1983 / Factors influencing on infantile mortality: Havana Province: 1983

El apoyo al Programa de Reducción de la Mortalidad Infantil, a partir de 1980 en la provincia de La Habana se realizan encuestas a todos los casos fallecidos menores de 1 año, en busca de factores relacionados con la causalidad del fenómeno. El modelo de Encuestas es llenado en los municipios por los médicos de las Areas de Salud y se completa en los niveles de atención secundaria. Se realiza un análisis de los 133 casos de muerte infantil del año 1983. Los principales factores causales o no, que estuvieron presentes fueron las dificultades administrativas y la anoxia intraparto (29,7) en el período neonatal precoz. La edad y malnutrición son los factores maternos más acentuados y por defecto de ambos se encuentran en gran número de pacientes. Entre los factores sociales se consideró la baja escolaridad y la procedencia rural

Importancia del control de mujeres en edad fértil en la disminución de la mortalidad infantil en Provincia La Habana: años 1979-1983 / Importance of the control of women at fertile age in the decrease of infantile mortality in Havana Province: 1979-1983

Se realiza el control del grupo de mujeres de 15-49 años desde 1979, mediante un modelo que recoge datos personales y relacionados con la anticoncepción de cada una de ellas. Conjuntamente se realizan acciones de salud con el objetivo de planificar la familia mediante métodos anticonceptivos en las mujeres controladas que puedan ser causa de mayor riesgo de morbimortalidad materna e infantil. Se indica que en el período estudiado se han controlado el 60% de mujeres de este grupo etario, de las cuales el 66,7% tenían algún método anticonceptivo transitorio. Se señala que la esterilización quirúrgica constituyó el 16,7% de estas mujeres, y que en el grupo de riesgo controlado, ésta se llevó hasta el 27,7% de los casos. Se observó en los 5 años siguientes una tendencia descendente de la mortalidad infantil y tasas inferiores a 16,4 por mil nacidos vivos

Control del estado nutricional de las mujeres en edad fértil como factor influyente en la disminución de la mortalidad infantil: provincia la habana, 1979-1983 / Control of nutritional status of women at fertilization age as influencing factor on dicrement of infantile mortality Havana province, 1979-1983

Se realiza una encuesta a 69.655 mujeres en edad fértil, de 15 a 49 años, en municipios de la Provincia La Habana. Se confecciona una tarjeta que recoge edad, peso, talla, valoración nutricional, además de los datos de identificación personal. Se efectúa un análisis de la valoración nutricional mediante los datos obtenidos en dicha encuesta, así como de la talla. Se describen acciones de salud sobre las mujeres malnutridas por defecto, en las que se produce el mayor riesgo de bajo peso al nacer, y se señalan las conclusiones